Análise filogenética dos genes HA e NA dos vírus influenza A em pacientes imunossuprimidos internados em Pequim durante o ano de 2018

Virology Journal volume 20, Número do artigo: 101 (2023) Citar este artigo

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Os vírus Influenza A sofreram rápida evolução com virulência; no entanto, dados completos e abrangentes sobre evolução gênica e variação de aminoácidos de HA e NA em pacientes imunossuprimidos eram poucos. Neste estudo, analisamos a epidemiologia molecular e a evolução dos vírus influenza A na população imunossuprimida, e a população imunocompetente foi usada como controle.

Sequências completas de HA e NA de A(H1N1)pdm09 e A(H3N2) foram adquiridas por meio de transcrição reversa-reação em cadeia da polimerase (RT-PCR). Os genes HA e NA foram sequenciados pelo método Sanger e analisados ​​filogeneticamente usando ClustalW 2.10 e software MEGA versão 11.0.

Durante as temporadas de influenza de 2018–2020, 54 pacientes imunossuprimidos e 46 imunocompetentes com teste positivo para vírus influenza A usando PCR quantitativo em tempo real (qRT-PCR) foram inscritos. Foram selecionadas aleatoriamente 27 amostras de swab nasal ou lavado broncoalveolar de imunossuprimidos e 23 de imunocompetentes e sequenciadas pelo método de Sanger. A(H1N1)pdm09 foi detectado em 15 amostras e as 35 amostras restantes foram positivas para A(H3N2). Ao analisar as sequências dos genes HA e NA dessas cepas de vírus, descobrimos que todos os vírus A(H1N1)pdm09 compartilhavam altas semelhanças entre si e os genes HA e NA desses vírus pertenciam exclusivamente ao subclade 6B.1A.1. Alguns genes NA dos vírus A(H3N2) não estavam no mesmo clado que os de A/Singapore/INFIMH-16-0019/2016 e A/Kansas/14/2017, o que pode ter levado o A(H3N2) a ser o dominante estirpe na temporada de gripe 2019-2020. Ambos os vírus A(H1N1)pdm09 e A(H3N2) mostraram padrões de linhagens evolutivas semelhantes de HA e NA entre pacientes imunossuprimidos e imunocompetentes. Em comparação com as cepas da vacina, não houve significância estatística dos genes HA e NA e das sequências de aminoácidos dos vírus influenza A em pacientes imunossuprimidos e imunocompetentes. No entanto, a substituição da resistência ao oseltamivir de NA-H275Y e R292K foi observada em pacientes imunossuprimidos.

Os vírus A(H1N1)pdm09 e A(H3N2) mostraram padrões de linhagens evolutivas semelhantes de HA e NA entre pacientes imunossuprimidos e imunocompetentes. Tanto os pacientes imunocompetentes quanto os imunossuprimidos apresentam algumas substituições importantes, que devem ser monitoradas, principalmente aquelas com potencial de afetar o antígeno viral.

Os vírus influenza incluem A, B, C e D, e entre esses quatro tipos, o tipo A é o mais infeccioso, podendo até causar uma pandemia com risco de vida [1]. A (H1N1) pdm09 e H3N2 são atualmente as principais cepas circulantes do vírus influenza A. O gene da hemaglutinina (HA) tem a mutação mais rápida dos oito genes do vírus influenza A, seguido pelo gene da neuraminidase (NA) [2]. O principal mecanismo de variação do vírus influenza A são deriva antigênica e rearranjos genéticos [3]. Estudos anteriores mostraram que a influenza A(H1N1)pdm09 foi derivada de vários vírus da influenza suína e transmitida a humanos nos meses anteriores ao surto [4, 5]. O monitoramento ativo do vírus influenza em nível molecular pode ajudar a entender a evolução do vírus influenza e selecionar melhores cepas vacinais [6, 7].

As literaturas e vigilâncias anteriores dos Centros de Controle e Prevenção de Doenças (CDC) da influenza no nível molecular eram principalmente de pacientes imunocompetentes [8, 9]. Com o progresso da tecnologia médica, pacientes imunossuprimidos submetidos a transplante de células-tronco hematopoiéticas (TCTH) ou transplante de órgãos sólidos (TOS), pacientes em hemodiálise crônica e pacientes recebendo corticosteroides sistêmicos, imunossupressores e reagentes biológicos têm aumentado a cada ano [10, 11,12]. Pacientes imunossuprimidos representaram 10,3% do estudo transversal multicêntrico global de 35.348 pacientes adultos com influenza publicado em 2020 [13]. Faltam dados completos e abrangentes sobre a evolução do gene influenza e variação de aminoácidos de HA e NA em pacientes imunossuprimidos, e não está claro se eles diferem de pacientes com pacientes imunocompetentes.