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Virology Journal volume 19, Número do artigo: 130 (2022) Citar este artigo

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Atualmente, ainda não existem drogas terapêuticas específicas e vacinas adequadas para a Dengue. Portanto, é importante explorar indicadores clínicos de diagnóstico distintos.

Neste estudo, combinamos análise de genes expressos diferencialmente (DEGs), análise de rede de coexpressão ponderada (WGCNA) e curva característica do operador receptor (ROC) para rastrear um biomarcador estável e robusto com valor diagnóstico para pacientes com dengue. O CIBERSORT foi usado para avaliar o cenário imunológico de pacientes com dengue. O enriquecimento de ontologia genética (GO), a análise da Enciclopédia de Genes e Genomas de Kyoto (KEGG) e a análise de enriquecimento do conjunto de genes (GSEA) foram aplicados para explorar as funções potenciais dos genes centrais.

CD38 e células plasmáticas têm excelente área sob a curva (AUC) na distinção de estágios clínicos para pacientes com dengue, e células T CD4+ de memória ativada e monócitos têm boa AUC para essa função. ZNF595 tem AUC aceitável em discriminar a febre hemorrágica da dengue (DHF) da febre da dengue (DF) em todos os estágios agudos. Analisando qualquer sorotipo, podemos obter resultados consistentes. A inibição negativa da replicação viral com base nos resultados da análise GO, KEGG e GSEA, genes autofágicos regulados positivamente e o sistema imunológico debilitado são razões potenciais que resultam em DHF.

CD38, células plasmáticas, células T CD4+ de memória ativada e monócitos podem ser usados ​​para distinguir estágios clínicos para pacientes com dengue, e ZNF595 pode ser usado para discriminar FHD de DF, independentemente dos sorotipos.

A dengue foi listada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) como uma das dez principais ameaças globais à saúde anunciadas no início de 2019 [1]. Nas últimas décadas, a Dengue se tornou a doença transmitida por mosquitos que mais cresce no mundo [2,3,4], colocando seriamente em risco a saúde humana [5, 6]. A pesquisa e o desenvolvimento de vacinas continuam progredindo [7,8,9,10,11,12], mas o aprimoramento dependente de anticorpos (ADE) limita a eficácia das vacinas [13,14,15,16,17]. Infecções assintomáticas aumentam a incidência de dengue [16, 18] e tratamentos eficazes não foram identificados. Portanto, é urgente explorar o mecanismo patogênico da dengue e selecionar marcadores moleculares para um melhor diagnóstico e tratamento.

A autofagia, um processo catabólico que degrada componentes intracelulares danificados ou anormais para recuperar nutrientes, é essencial para manter a homeostase celular e corporal [19, 20] e beneficia a proliferação e infecção do vírus da dengue (DENV) [21,22,23, 24]. Na infecção por DENV-ADE, os anticorpos de reação cruzada mediam a infecção induzindo proteínas relacionadas à autofagia e, em seguida, suprimem a imunidade inata mediada pela proteína antiviral da mitocôndria (MAVS) [25]. A resposta imune afeta direta ou indiretamente a resposta do hospedeiro ao DENV em vários graus, incluindo infecção sintomática, infecção assintomática [26, 27], síndrome do choque da dengue (DSS) e febre hemorrágica da dengue (FHD) [28,29,30]. Portanto, é essencial explorar a autofagia e a resposta imune durante a infecção por DENV.

As pesquisas transcriptômicas são benéficas para auxiliar os pesquisadores a entender melhor as causas das doenças [31] e localizar biomarcadores [32,33,34]. Nossas preciosas pesquisas transcriptômicas contribuíram para entender a evolução viral e seu impacto na patogenicidade e desenvolvimento de vacinas de DENV [35,36,37,38]. No entanto, estudos [39,40,41] publicados focaram em pesquisas multigênicas e método analítico único (análises de genes expressos diferencialmente (DEGs)) e não vincularam a genômica às paisagens imunes. Neste estudo, usamos uma combinação de análises DEG, análise de rede de coexpressão ponderada (WGCNA) e curva característica do operador receptor (ROC) para identificar, validar e testar biomarcadores com valor diagnóstico de estágios e gravidade em conjuntos de dados independentes, e aplicamos o Site CIBERSORT para analisar as diferenças do cenário imunológico entre três estágios e entre FHD e Febre da Dengue (DF) e explorar correlações entre genes e células imunes.