Lançamento antecipado

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Citação sugerida para este artigo

Isolamos 5 vírus altamente patogênicos da influenza aviária A(H5N1) clade 2.3.4.4.b de fezes de aves aquáticas selvagens na Coreia do Sul em novembro de 2022. O sequenciamento do genoma completo e a análise filogenética revelaram novos genótipos produzidos pelo rearranjo com vírus da influenza aviária de baixa patogenicidade da Eurásia. Vigilância reforçada será necessária para melhorar as estratégias de prevenção e controle.

Os vírus altamente patogênicos da influenza aviária (HPAIVs) causaram grandes perdas econômicas na indústria avícola e são uma grande ameaça à saúde pública. Desde a primeira detecção de HPAIV A (H5N1) de um ganso em 1996 em Guangdong, China, seus descendentes evoluíram para múltiplos clados específicos do gene da hemaglutinina (HA) (H0–H9) e subclados (1) causando epizootias intercontinentais (2) . Ao longo de várias décadas, os H5 HPAIVs evoluíram para vários subtipos e genótipos gerados pelo rearranjo com vírus da influenza aviária de baixa patogenicidade (LPAIVs), o que levou ao surgimento do clado 2.3.4.4 H5Nx HPAIVs no leste da China durante 2013–2014 (3).

Em meados de 2016, H5N8 clado 2.3.4.4b HPAIVs recombinantes que continham genes internos de LPAIVs da Eurásia foram detectados em aves selvagens no lago Uvs-Nuur na Rússia e no lago Qinghai na China (4); os vírus causaram grandes surtos na Europa durante 2016–2017 (5). Posteriormente, vários novos H5N8 HPAIVs recombinantes foram detectados na Eurásia (5,6). No final de 2020, novos clados recombinantes 2.3.4.4b H5N1 HPAIVs foram detectados e se tornaram predominantes na Europa em aves domésticas e selvagens (5).

Isolamos 5 H5N1 HPAIVs de fezes de aves silvestres coletadas na Coreia do Sul em novembro de 2022 (Apêndice 1): A/Spot-billed_duck/Korea/K22-730-1/2022(H5N1) [K22-730-1], A/Wild_bird /Korea/K22-742/2022(H5N1) [K22-742], A/Spot-billed_duck/Korea/K22-856-2/2022(H5N1) [K22-856-2], A/Spot-billed_duck/Korea /K22-862-1/2022(H5N1) [K22-862-1] e A/Spot-billed_duck/Korea/K22-920/2022(H5N1) [K22-920] (Apêndice 1 Tabela 1). Para compartilhar rapidamente as informações, realizamos o sequenciamento do genoma completo dos isolados e depositamos as sequências do genoma no banco de dados GISAID (https://www.gisaid.org).

Todos os isolados de H5N1 foram classificados como HPAIV com base nas sequências de aminoácidos do sítio de clivagem HA (PLRPKRRKR/G). Os 5 isolados compartilharam altas identidades de sequência de nucleotídeos (99,4% a ≈100%) em todos os 8 genes da gripe, exceto para a proteína básica 1 da polimerase isolada K22-920 (PB1), proteína ácida da polimerase (PA), nucleoproteína (NP) e genes não estruturais (NS) (93,0% a ≈99,0%). Os resultados da pesquisa do BLAST (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov) mostraram que os genes HA, neuraminidase e proteína da matriz (M) de todos os isolados tinham > 99,1% de identidades com 2021–2022 clade 2.3.4.4b HPAIVs (Tabela 1). Os genes PB1, PA, NP e NS de todos os isolados foram altamente semelhantes (98,72% a 99,52%) aos LPAIVs de 2019 a 2022 do leste da Ásia. Os genes PB1, PA, NP e NS de K22-920 foram semelhantes aos LPAIVs 2019–2020 da Coreia do Sul, Rússia e Bangladesh (>98,4%–99,3%).

figura 1

Figura 1. Análise filogenética de novos vírus altamente patogênicos da gripe aviária A(H5N1) clade 2.3.4.4b encontrados em fezes de aves selvagens na Coreia do Sul, novembro de 2022. A) Representação esquemática da origem dos vírus isolados...

Em análises filogenéticas de máxima verossimilhança, os genes PB2, HA, neuraminidase e M dos 5 vírus H5N1 da Coreia do Sul agruparam-se com os dos vírus anteriormente descritos como genótipo G10, identificados na China durante 2022–2023 (Apêndice 1, Figuras 1–8) ; G10 é um recombinante natural H5N1 HPAIV contendo o gene PB2 de LPAIVs (7). Genes PB1, PA, NP e NS de todos os vírus H5N1 da Coréia do Sul, exceto K22-920 agrupados com os de LPAIVs da Ásia; esses segmentos de genes em K22-920 agrupados separadamente com outros LPAIVs da Ásia, incluindo Coréia do Sul, Rússia e Bangladesh (Apêndice 1, Figuras 2, 3, 5, 8). A filogenia bayesiana do gene HA indicou que os vírus H5N1 da Coréia do Sul formaram um cluster bem suportado; o tempo para o ancestral comum mais recente foi estimado em 11 de agosto de 2022 (95% da maior densidade posterior de 11 de junho a 11 de outubro de 2022), sugerindo que os H5N1 HPAIVs provavelmente surgiram 1 a 2 meses antes da migração de pássaros selvagens de outono para a Coreia do Sul (Figura 1; Apêndice 1 Figura 9). Os isolados da Coréia do Sul compartilharam um ancestral comum recente com o vírus A/Jiangsu/NJ210/2023(H5N1); o tempo para o ancestral comum mais recente entre eles foi 12 de abril de 2022 (95% da densidade posterior mais alta de 26 de dezembro de 2021 a 28 de julho de 2022), sugerindo que os H5N1 HPAIVs ancestrais estavam circulando sem serem detectados por ≈ 7 meses.